Donanma Komutanlığı’nda yapılan aramada ele geçirilen ve Balyoz davasının temel dayanaklarından olan 5 No’lu harddisk ile ilgili Genelkurmay Başkanı Orgeneral Necdet Özel’in verdiği soruşturma emrinin de işe yaramadığı ortaya çıktı.

Genelkurmay Başkanı Orgeneral Özel’in, ocak ayı sonunda verdiği soruşturma emri doğrultusunda, döşeme altından çıkan harddiskle ilgili bilgisi bulunabileceği değerlendirilen Donanma Komutanlığı İstihbarat İKK ve Güvenlik Şube’de görev yapan tüm personelin ifadesinin alınması ve sorgulanması bekleniyordu. Askeri gizlilik dereceli belgeler içermesine karşın harddisklerin yürürlükteki yönerge ve usullere uygun olarak muhafaza edilmemesi, İstihbarat İKK ve Güvenlik Şube’ye ait odalara giriş-çıkış ve belgelerin muhafazası konularında güvenlik açığı oluşturulmuş olmasının da soruşturma kapsamında ele alınacağı ifade ediliyordu. İçeriği ile oynandığı öne sürülen 5 No’lu harddiske en son kimin erişimde bulunduğu ve hangi bilgisayarlara bağlandığının da savcılık tarafından masaya yatırılacağı belirtiliyordu. Soruşturma kapsamında ayrıca, harddisk üzerinde bulunan parmak izlerinin kime ait olduğunun da belirlenmesi bekleniyordu.

Ancak iki kez “Kovuşturmaya yer yok" kararı veren Donanma Savcılığı, bu sefer de “görevsizlik kararı” verdi.

Donanma Savcılığının bu tutumu 5 Nolu Hard Disk'in hazırlanmasında üst rütbeli komutanların bilgi sahibi olduğuve  bu konu soruşturulursa hükümet ile yapılan işbirliğinin açığa çıkmasından korkulduğu hakkında düşüncelerin oluşmasına sebep oluyor.